Bonito tem das melhores infra-estruturas de ecoturismo em funcionamento no interior brasileiro. Devido às características de atividades como flutuação, pesca esportiva em certas épocas, trilhas, rapel e travessia de cachoeiras em botes, todo o turismo é organizado através de agências. Não há como simplesmente chegar e ir aos passeios se não estiver integrado em grupos guiados, transportados até os ecopontos.